食用菌深加工车间设计面对的是高湿度、易霉变、粉尘与孢子并存的特殊生产环境。香菇、木耳、灵芝等食用菌在烘干、粉碎、破壁、提取、包装过程中，产生大量粉尘和孢子，同时食用菌本身易吸潮霉变。食用菌深加工车间设计必须把洁净分级、除尘防霉和温湿度控制作为三条主线协同推进。

       在食用菌深加工车间设计中，净化级别需要达到万级标准，高效过滤器出风口需要达到百级。车间内应加装紫外线杀菌灯和臭氧发生器，接种室达到百级洁净度。食用菌深加工车间设计中，整体采用稳固钢混、砖砌主体结构搭配阻燃洁净彩钢板围护，结构密封性强、不易积尘、防潮防霉，适配食用菌高湿生产环境。地面选择防霉、防滑、耐磨、易清洁材料，室内墙面采用不锈钢等耐腐蚀材料。

       食用菌深加工车间设计中，粉碎和破壁工序是粉尘产生的主要环节。应根据粉碎破壁方式设置适宜的通风、除尘设施，保持空气洁净，有效去除和隔离飞溅的粉末。除尘设备须防爆设计，电气设备按防爆要求选型。食用菌深加工车间设计中，烘干工序产生大量水蒸气和热量，应设置独立排风系统，及时排出水蒸气，防止车间结露。包装间应保持正压，空气经过过滤，人员进入需更衣消毒，包装材料进入洁净区前应脱外包并消毒。食用菌深加工车间设计的验收重点包括：洁净度监测、除尘系统效果、防霉涂层效果、温湿度控制和排水通畅性。